| Geneva report for 1790294 | |
| General information | |
| Genbank ID: | 1790294 |
| Gene name: | polA(synonym b3863) |
| COG | COG0749 |
| Current annotation: | DNA polymerase I, 3' --> 5' polymerase, 5' --> 3' and 3' --> 5' exonuclease |
| BLOCKS information | |
| BLOCKS hits | :IPB001098: |
| BLOCKS diagram | |
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| PRINTS information | |
| PRINTS hits | :PR00868: |
| PRINTS diagram | |
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| Pfam information (readme) | |
| PFAM hits | :5_3_exonuc_N::DNA_pol_A::3_5_exonuclease::5_3_exonuclease: |
| PFAM diagram | |
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| Variability information from nongapped BLAST | |
| Variability profile(0-conserved,1-variable,red line - variable region) | |
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| Query anchored nongapped BLAST alignment (blue-aligned block, yellow-unaligned block with similar length,grey-unaligned gap-rich block readme) | |
| Clustering on variable region (hierachical clustering,average percent identity between clusters < 30%) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| On query region 224 to 352, total sequences extracted for clustering = 150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Short motifs reported by MEME(readme) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MEME motif diagram in this region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Motif alignments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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